По преданию, на месте церкви Иоанна Предтечи стоял женский Воскресенский монастырь, который в 1609 г. был разорён поляками. Самое раннее свидетельство о церкви относится к 1644 г. В 1665 г. на средства местных жителей было построено каменное здание Воскресенской церкви с приделом Казанской Богоматери. В 1671 г. началось строительство холодного храма в честь Усекновения Главы Иоанна Предтечи. Средства на строительство собирали всем приходом. Только в 1687 г. состоялось освящение церкви. Сооружение представляло собой четырехстолпную пятиглавую церковь с крытыми одноэтажными галереями с трех сторон. Входом в галереи были высокие щипцовые крыльца на столбах. Храм имел два симметричных придела, выполненных одинаковыми по высоте с основным кубом, увенчанными изящными пятиглавиями, что впервые использовалось в ярославском зодчестве. Пятнадцать глав церкви были разбиты на три группы.  Позднее, в 1690 г. сооружена шестиярусная колокольня в стиле "московского барокко". В 1694-1695 гг. были проведены работы по росписи главного храма. В конце XVIII столетия были проведены работы по замене глав церкви. В 1773-1784 гг. поставили новые боковые главы, а в 1792-1794 гг. центральной главе была придана форма бутона в барочном стиле. В 1859 г. на средства купца Ф. И. Крашенинникова была вызолочены все главы и кресты летнего и зимнего храмов. В 1885 г. при церкви открылась церковно-приходская школа, одна из первых в Ярославле. В 1891 г. было учреждено первое в Ярославле общество трезвости. В 1894 г. открылся детский приют. В 1902 г. на капитальный ремонт церкви из Государственного казначейства было выделено 64 тыс. рублей. Масштабные работы завершились в 1906 г. После революции начался процесс ликвидации церковной общины. В мае 1935 г. она прекратила своё существование. В 1936 г. здание церкви перешло в ведение завода “Победа рабочих”. Только благодаря вмешательству Главнауки удалось приостановить варварское использование храма. В 1958 г. под руководством Э. М. Генделя были проведены уникальные работы по выпрямлению колокольни. Церковь Иоанна Предтечи входит в состав Ярославского музея-заповедника.    

Дараган В. Жемчужина русской архитектуры // Наука и религия. 2010. № 9 (сентябрь). С. 30-31.

“Золотой” век в истории Ярославля // Деловые вести Ярославии. 2003. № 3. С. 54-55.

Низовский А. Ю. Церковь Иоанна Предтечи в Толчкове // Самые знаменитые монастыри и храмы России. М., 2004. С. 103-106.

Первухин Н. Г. Церковь Иоанна Предтечи в Ярославле. М., 1913. 60 с.

Успенский Ф. Предтечевская церковь в Ярославле. Ярославль, 1906. 51 с.

Церковь Иоанна Предтечи в Толчковской слободе // Рутман Т. А. Храмы и святыни Ярославля. Ярославль, 2005. С. 431-447.

Церковь Иоанна Предтечи в Ярославле. [Переизд.]. Ярославль, 2001. 194 с.

Церковь Иоанна Предтечи с колокольней в бывшей Толчковой слободе // Козлов П. И. Ярославль: путеводитель. Ярославль, 1956. С. 159-164.

Трацевский Б. Н., библиограф отдела краеведения ЯОУНБ им. Н. А. Некрасова